המעבדה בעמק הירדן קיימת משנת 1950, נמצאת בבעלות צמח מפעלים אזוריים עמק הירדן ונותנת שירות לחקלאים, מכוני מחקר, אוניברסיטאות, מכללות, חברות פרטיות וממשלתיות. מטרת הבדיקות המבוצעות במעבדה הן לעזור לחקלאי, למדריך ולחוקר לאתר בעיות קרקע או גידול במידה וישנן, העלולות להפריע למהלך גידול תקין של הצמח.

כמו כן הבדיקות מסייעות לקבוע את מנת הדשן שיש לתת לגידול על מנת להשיג תוצאות אופטימאליות תוך חיסכון מרבי בדשנים ובמים, להפחית שימוש עודף של כימיקלים וכך לתרום לאיכות הסביבה ושימור הקרקע.

החומרים הנבדקים במעבדה הם: קרקע, מצעי גידול, מים, שפכים וקולחים, תמיסות הזנה, חומר צמחי, דשנים נוזליים ומוצקים, קומפוסט וזבל אורגני.

החל משנת 2012 קיבלה המעבדה הכרה מטעם משרד הבריאות לבדיקות מי קולחין ושפכים.

מעבדת קרקע, מים והזנת הצמח מתמחה גם בייעוץ אגרונומי ובביצוע סקרי קרקע. ממצאי הסקרים שנערכו בחלקות עמק הירדן ע"י אמקה כנרתי ואחריו ע"י נורית בן הגיא במהלך למעלה מחמישים שנה, כוללים תוצאות בדיקות מעבדה. דוגמאות של רגבי קרקע שמורות בארכיון קרקעות ייחודי מסוגו בארץ יחד עם תיאור חתך הקרקע והמלצה על התאמת החלקה הנסקרת לנטיעה. נתונים אלה מוחשבו ב-GIS (ממ"ג) המאפשרת גישה נוחה לנתונים.

המעבדה גם מספקת שירותי דיגום בחלקות או מאגרים. הדיגום מבוצע על ידי דוגם מוסמך, על פי מטרת הפנייה, פרוטוקולים קיימים ודרישות הרגולציה.

באתר מפורסמות הנחיות ומועדי דיגום קרקע ועלים על פי סוג הגידול ומטרת הדיגום.

המעבדה מספקת כלי דיגום לתמיסות (כולל כלים סטריליים ) על פי מטרת הדיגום וכן שקיות לדיגום קרקע.